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产品简介
CRISPR–Cas12a蛋白(又称Cpf1 ),是一种原核脱氧核糖核酸酶,可以通过向导RNA进行编程,以靶向互补的DNA序列。与靶DNA结合后,CRISPRCas12a蛋白在每条靶DNA链中诱导切割,产生双链DNA断裂。除了诱导靶DNA的顺式切割之外,靶DNA结合还诱导非靶DNA的反式切割。
产品信息
产品名称 | CRISPR–Cas12a蛋白 | 数量 | 1份 |
英文名称 | Cas12a Nuclease | 形式 | 液体 |
产品货号 | QE005 | 储存条件 | -20 ℃ |
产品组成 | Cas12a Nuclease Cas12a Reaction Buffer(10×) | 产品规格 | 50 pmol + 1 mL |
产品用途
1. 利用Cas12a对DNA检测信号放大,应用于实时荧光法和胶体金法检测。
2. 利用Cas12a筛选crRNA,通过CRISPR实现基因的敲除/敲入。
产品质控
RNase残留检测:2μg本酶与293T Cell RNA 37℃ 孵育30 min,经琼脂糖凝胶电泳,RNA电泳图谱未发生变化。
核酸内切酶残留检测:2μg本酶与0.3μg 载体37℃ 孵育4 h,经琼脂糖电泳,质粒电泳谱带不发生变化。
核酸外切酶残留检测:2μg本酶与50pmol单链DNA底物和双链DNA底物37℃孵育16 h,经非变性PAGE电泳,DNA的电泳谱不发生变化。
大肠杆菌DNA残留检测:0.5μg本酶中残留的核酸经E.coli gDNA特异性的TaqMan qPCR检测,E.coli基因组残留低于10拷贝。
实验步骤
A.使用Cas Nuclease体外切割DNA操作方案:
1. 按顺序配置反应体系(30μL):
组分 | 体积(μL) |
crRNA | 3 |
Cas12a Nuclease | 1 |
Cas12a Reaction Buffer(10×) | 3 |
RNase Free Water | 20 |
Total | 27 |
注意事项:
Ⅰ 一般使用30ul体系。但也可等比例放大;
Ⅱ 实验前请使用无核酸酶的水将crRNA稀释到300nM;
Ⅲ 请佩戴口罩并使用无核酸酶的耗材与试剂,避免实验过程crRNA的降解。
2. 37℃孵育10min
3. 加入3ul 30nM的靶标DNA(使用无核酸酶的水稀释)
4. 震荡混匀并短暂离心收集
5. 37℃孵育30 min,75℃灭活15min
6. 反应产物可直接进行琼脂糖凝胶电泳分析
B.使用Cas Nuclease荧光检测操作方案
1. 按顺序配置反应体系(50μL):
组分 | 体积(μL) |
Cas12a (1 μM) | 5 |
crRNA (1 μM) | 5 |
探针 (5 μM) | 5 |
Cas12a Reaction Buffer(10×) | 5 |
检测样品+Rnase free water | up to 30 |
RNase Free Water | 25 |
注意事项:
Ⅰ 一般使用50ul体系。但也可等比例放大;
Ⅱ 实验前请使用无核酸酶的水将crRNA稀释到1μM;
Ⅲ 请佩戴口罩并使用无核酸酶的耗材与试剂,避免实验过程crRNA的降解。
2.避光条件下,转移至荧光定量PCR仪
3.反应程序,37℃ 5s ;40℃ 40s收集荧光1次 20个循环;4 ℃ 10s
4.反应结束观察荧光判定结果
注意事项
1. 实验中,请保持实验区干净整洁,操作时需穿戴干净的手套、口罩,实验所用枪头、离心管等耗材均为 Nuclease-free。
2. Cas12a Nuclease 对热敏感,应全程冰上配置体系,在使用后立即将酶置于-20℃保存。
3. 实验中,sgRNA 很关键,可以根据 target DNA 选择最佳的 sgRNA 序列。重视 sgRNA 的保存,防止降解失效。
常见问题及解决方案
为什么观察到条带切割不完全?
1. 为了保证最高的切割效率,Cas12a Nuclease和crRNA与target DNA的摩尔比例至少为10:10:1或者更高。
2. 可能与crRNA的序列有关,可以根据target DNA选择最佳的crRNA序列;
3. 可能由于crRNA降解引起的,可以通过凝胶电泳验证crRNA完整性。
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